Trace数据库简介

测序峰图(Trace)是测序仪生成的峰图文件,是序列最原始数据。Trace数据的整理、存储对于生物研究有着重要的意义。
Trace数据库是由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护。其数据来源可以分为两部分:用户直接提交,以及生物信息科学数据共享平台根据需要从其他生物信息中心(如NCBI、EBI)下载的Trace数据。
Trace数据库接受研究者、研究组织、基因组测序项目和专利申请者提交的Trace数据并予以发布,注册用户可以通过FTP批量提交数据。
Trace数据库对用户提供免费的数据查询、数据在线下载服务。数据库提供了接收号、基因名称、来源、机构、物种、发布日期、提交者等多个检索项,用户可以选择使用普通检索或高级检索对数据库的进行多方式的检索查询。对于查询的结果,数据库提供了多种格式供用户浏览、下载。
生物信息科学数据共享平台将定期发布Trace数据,发布的数据分FASTA和FULL两种格式,用户可以通过FTP或者光盘获取Trace数据。
欢迎使用我们的Trace数据库,并提出宝贵意见。
数据示例
- 有关日本血吸虫的记录
- 编号(Trace ID)为3034762的记录
- 中心名称(Center Name)为CHGCS的记录
- 来源类型(Source Type)为GENOMIC的记录
- Trace名称(Trace Name)为bgi_a0_00001_02.g1的记录
- 化学类型(Chemistry Type)为TERM的记录
- Tax编号(Tax id)为6182的记录
- 生物名称(Organism)为SCHISTOSOMA JAPONICUM的记录
关于检索的使用说明,点击这里
关于序列提交的说明,点击这里
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