物种分类简介

物种分类(Taxonomy)数据库是由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护的,为生物信息科学数据共享平台内的其他数据提供物种及分类方面的支持。数据库的物种分类信息主要来源于 NCBI taxonomy数据库,数据库收录的物种信息包括物种的分类文献、出版物、基于web的数据库、序列提交者的建议等。但该数据库不为分类学或者系统发育学提供参考标准。我们定期会对数据库进行更新。

Taxonomy数据库对用户提供免费的数据查询数据在线下载服务。数据库提供了物种编号、学名、同义名、分类界元、世系、子树等多个检索项,用户可以选择使用普通检索或高级检索对数据库的进行多方式的检索查询,对于查询的结果,数据库提供了多种格式供用户浏览、下载。每条记录都有到有到核酸、蛋白质、文献等相关数据库的链接。还提供了common tree工具,用户可以根据需要构建不同的物种树。


数据示例

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