STS数据库简介

序列标签位点(Sequence Tagged Sites, STS)是基因组序列标记位点,其主要来源有随机位点序列、表达基因序列、遗产标记序列等。STS提供染色体定位信息,对基因作图、基因定位具有重要意义。
STS数据库是由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护。其数据来源可以分为两部分:用户直接提交,以及生物信息科学数据共享平台根据需要从其他生物信息中心(如NCBI、EBI)下载的STS序列数据。
STS数据库接受研究者、研究组织、基因组测序项目和专利申请者提交的STS序列数据并予以发布,注册用户可以通过FTP批量提交数据。
STS数据库对用户提供免费的数据查询、数据在线下载服务。数据库提供了接收号、文库名称、克隆号、物种、发布日期、提交者等多个检索项,用户可以选择使用普通检索或高级检索对数据库的进行多方式的检索查询。对于查询的结果,数据库提供了多种格式供用户浏览、下载。
生物信息科学数据共享平台将定期发布STS数据,发布的数据分FASTA和FULL两种格式,用户可以通过FTP或者光盘获取STS数据。
欢迎使用我们的STS数据库,并提出宝贵意见。
数据示例
- AC号为AB004254的记录;
- ID为304230的记录;
- 02-01-2002发布的记录(Entry Date 格式为月-日-年);
关于检索的使用说明,点击这里
关于序列提交的说明,点击这里
