GSS数据库简介
SRA

基因组勘测序列(Genome Survey Sequences,GSS)是基因组DNA克隆的一次性部分测序得到的序列。包括随机的基因组勘测序列、cosmid/BAC/YAC末端序列、通过Exon trapped获得基因组序列、通过Alu PCR获得的序列、以及转座子标记(transposon-tagged)序列等。

GSS数据库是由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护。其数据来源可以分为两部分:用户直接提交,以及生物信息科学数据共享平台根据需要从其他生物信息中心(如NCBIEBI)下载的GSS序列数据。

GSS数据库接受研究者、研究组织、基因组测序项目和专利申请者提交的GSS序列数据并予以发布,注册用户可以利用FTP批量提交数据

GSS数据库对用户提供免费的数据查询数据在线下载服务。数据库提供了接收号、文库名称、克隆号、物种、发布日期、提交者等多个检索项,用户可以选择使用普通检索或高级检索对数据库的进行多方式的检索查询。对于查询的结果,数据库提供了多种格式供用户浏览、下载。

生物信息科学数据共享平台将定期发布GSS数据,发布的数据分FASTA和FULL两种格式,用户可以通过FTP或者光盘获取GSS数据。

欢迎使用我们的GSS数据库,并提出宝贵意见。


数据示例

  • AC号BH175042的记录;
  • 10-11-2001发布的记录(Entry Date 格式为月-日-年);

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关于序列提交的说明,点击这里