EST数据库简介
SRA

表达序列标签(Expressed Sequence Tag, EST)是基因表达的短cDNA 序列。EST序列携带着基因的某些信息,是寻找新基因、了解基因在基因组中的定位及其精细结构、mRNA可变剪接等研究的重要依据和基础。EST主要应用于新基因克隆、基因组图谱绘制、基因组序列编码区的确定等方面。

EST数据库是由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护。其数据来源可以分为两部分:用户直接提交,以及生物信息科学数据共享平台根据需要从其他生物信息中心(如NCBIEBI)下载的EST序列数据。

EST数据库接受研究者、研究组织、基因组测序项目和专利申请者提交的EST序列数据并予以发布,注册用户可以通过FTP批量提交数据

EST数据库对用户提供免费的数据查询数据在线下载服务。数据库提供了接收号、文库名称、克隆号、物种、发布日期、提交者等多个检索项,用户可以选择使用普通检索或高级检索对数据库的进行多方式的检索查询。对于查询的结果,数据库提供了多种格式供用户浏览、下载。

生物信息科学数据共享平台将定期发布EST数据,发布的数据分FASTA和FULL两种格式,用户可以通过FTP或者光盘获取EST数据。

欢迎使用我们的EST数据库,并提出宝贵意见。


数据示例

  • AC号为 FK253350的记录;
  • Clone id为3B11的记录;
  • 2-24-2005发布的记录(Entry Date 格式为月-日-年);

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