EST帮助
高级查询
在SDSPB的首页上点击“基础数据资源”按钮，选择“EST数据库”进入EST数据库主页。在EST数据库主页的左侧栏点击“高级检索”，进入如下图的高级检索页面：
EST数据库提供了限定词查询，以缩小查询的范围。可以使用的限定查询词有ID、Name、CAC、DNA Type、Clone ID、Entry Date、Library Name、Tax ID、Organism、Submitter Name等10种。
10种限定词之间可以使用“AND”和“OR”相连接，其中“AND”表示查询的结果中必须包含它所连接的两个关键词，“OR”表示查询的结果中至少包含它所连接的关键词中的一个。
除了使用以上的10种限定词进行查询外，用户还可以指定序列的最后修改日期，即在“限定年份”中指定某一年或者某几年。
限定词说明
EST数据库中相关的限定词说明如下：
| 限定词 | 描述 |
|---|---|
| ID | EST序列的入库时的流水号 |
| Name | EST序列的名称 |
| CAC | 数据在SDSPB中的AC号 |
| DNA Type | DNA的类型 |
| Clone ID | 克隆号 |
| Entry Date | 数据创建日期 |
| Library Name | 文库名称 |
| Tax ID | 物种分类号 |
| Organism | 物种名称 |
| Submitter Name | 提交者姓名 |
显示格式说明
EST数据库的查询结果显示有三种格式：“Summary”、“FASTA”和“Full”。其中Summary为默认的查询结果显示方式。
"Summary" 格式
Summary格式显示查询序列的摘要性信息，由两行信息组成：
第一行显示信息为EST序列的CAC号和序列的类型。
第二行显示信息分别为：EST序列的名字、EST序列的来源物种、EST来源DNA的类型以及克隆ID。
"FASTA" 格式
EST序列的FASTA格式第一行显示为EST序列的CAC号，第二行以“〉”开头，后跟EST序列的CAC号、序列的名字、文库的名字、序列来源物种、序列来源DNA类型、克隆ID以及其它描述信息。第三行为EST序列的详细序列数据。
"Full" 格式
Full格式显示了一个EST序列的详细信息，主要有序列的标识信息、克隆信息、文库信息、序列提交者信息等，常见的字段信息如下：
| 字段 | 意义 |
|---|---|
| IDENTIFIERS | EST序列的相关标识信息 |
| ID | EST序列提交时产生的流水号 |
| EST name | EST序列的名字 |
| CAC | EST序列在B中的唯一标识号 |
| DBNAME | 交叉引用的数据库名称 |
| DBXREF | 交叉引用的数据库编号 |
| CLONE INFO | 有关克隆的信息 |
| Clone id | 克隆号 |
| DNA type | EST来源DNA的类型 |
| PRIMERS | 有关引物的信息 |
| PolyA tail | 有无PolyA尾巴 |
| SEQUENCE | EST序列 |
| Entry created | EST序列录入时间 |
| COMMENTS | 对EST序列的评论 |
| LIBRATY | 有关文库的信息 |
| Lib name | 文库的名字 |
| Organism | 制作文库用的生物物种 |
| Vector | 载体类型 |
| R. Site 1 | 载体的限制性酶切位点1 |
| Description | 描述文库的准备方法，载体等 |
| Name | 提交者姓名 |
| Lab | 提交者实验室名字 |
| Institution | 提交者所在机构 |
| Address | 提交者地址 |
| Tel | 电话 |
| Fax | 传真 |
| 电子邮件 | |
| CITATIONS | 有关引用的信息 |
| Title | 引用EST的文章标题 |
| Authors | 引用EST的文章作者 |
| Year | 创作的年份 |
数据下载流程
SDPSB的EST数据库提供如下两种数据下载方式：
1）下载打包的EST数据
点击EST数据库页面的左侧栏中的“数据下载”，你可以FTP下载我们发布的所有EST数据。
2）下载查询到的核酸序列数据
在查询结果的页面，选择“Summary”、“FASTA”和“Full”三种格式中的一种，然后点击“下载”按钮，即可下载你所查询到的结果中你选中的EST序列数据，如果空选，则下载查询结果中当前页面的全部核酸序列数据。
数据提交
如果您有数据向我们提交，请参见：数据提交
