蛋白质数据库是由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护。其数据来源主要是UniProt数据库。UniProt数据库是一个经过整理后的蛋白质序列数据库，它致力于提供一个高水平的注释（例如描述蛋白质的功能、作用域结构、翻译后修饰、突变体等）、最低水平的冗余以及与其它数据库的整合。

蛋白质数据库对用户提供免费的数据查询、数据在线下载服务。数据库提供了接收号、描述、关键字、物种、序列长度等多个检索项，用户可以选择使用普通检索或高级检索对数据库的进行多方式的检索查询。对于查询的结果，数据库提供了多种格式供用户浏览、下载。

生物信息科学数据共享平台将定期从UniProt获取原始数据，并发布蛋白质数据，发布的数据分FASTA和SwissProt两种格式，用户可以通过FTP或者光盘获取蛋白质数据。

欢迎使用我们的蛋白质数据库，并提出宝贵意见。

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数据示例

• AC号为Sjc_0028040的记录；
• 登记名称（Entry Name）为Sjc_0028030的记录；
• 描述中（Description）包含organic anion transporter的记录；
• Tax编号（Tax ID）为6182的记录；
• 物种名称（Organism）为Schistosoma japonicum的记录；
• 长度（Length）924的记录；
• 分子量（Molecular Weight）为103626的记录；

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