普通核酸数据库简介

普通核酸(CoreNucleotide)是指除EST、GSS、STS以外的其他核酸序列。普通核酸数据库由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护。其数据来源可以分为两部分:用户直接提交,以及生物信息科学数据共享平台根据需要从其他核酸数据库(如Genbank、EMBL)中下载的数据。
普通核酸数据库接受研究者、研究组织、基因组测序项目和专利申请者提交的核酸序列数据。注册用户可以通过在线或者FTP批量提交数据。
普通核酸数据库对用户提供免费的数据查询、数据在线下载服务。数据库提供了接收号、文献、作者、序列长度等多个检索项,用户可以选择使用普通检索或高级检索对数据库的进行多方式的检索查询。对于查询的结果,数据库提供了多种格式供用户浏览、下载。
生物信息科学数据共享平台将定期发布普通核酸数据,发布的数据分FASTA和GENBANK两种格式,用户可以通过FTP或者光盘获取普通核酸数据。
欢迎使用我们的普通核酸数据库,并提出宝贵意见。
数据示例
- 长度(Sequence Length)等于1000bp的记录;
- 关键字(Keyword)中包含WGS的记录;
- 定义(Definition)中包含whole genome shotgun sequence的记录
- 生物体(Organism)为Schistosoma的记录
- 作者(Author)为Zhao,G.P.的记录
- 分子类型(Molecule Type)为mRNA的记录
关于检索的使用说明,点击这里
关于序列提交的说明,点击这里
