活性小分子功能筛选平台

活性小分子功能筛选平台,是一个基于活性小分子筛选和功能探索的新药研发信息整合系统。运用生物信息学和化学信息学方法,针对转录组信息、小分子结构功能信息、药靶信息、蛋白-配体相互作用信息等进行深入挖掘,为小分子功能预测和新药开发提供指导。主要包含四大模块: (1)基于转录组的功能相似性搜索(2)基于小分子结构的功能预测(3)基于反向对接策略的候选靶标预测(4)药物数据库

基于转录组的功能相似性搜索GEMBlast
(基于转录组的功能相似性搜索)

GEMBlast是一个基于网络的的工具,提供了一个用户友好界面,实现了GEMS2方法(Yun Li等,2008年),并执行基于模块的基因表达谱对参考含有不同类型的基因表达图谱数据库进行相似性搜索。它的特点是提供了一个与人相关的表达谱参考资源库,并允许使用从几个不同的基因功能分类标准来作为基因功能模块分类。

基于反向对接策略的候选靶标预测MaxDock
(基于反向对接策略的候选靶标预测)

集成M/X打分函数的反向对接策略识别药物多靶点网络服务器。

多靶点药物的发展揭示了对抗如神经退行性疾病、心血管疾病,癌症等各种疾病的新途径。现今有近35%已知药物或先导化合物作用于多靶点,而一个药物的多个靶点又分布于不同的病理通路中。

基于小分子结构的功能预测M & Function
(基于小分子结构的功能预测)

这是一个整合了生物信息学和化学信息学资源的小分子药物数据库,包含了小分子药物的结构、功能、分类、活性等信息。 数据库中共含有1402个FDA认证的小分子药物及5223个已经进入临床验证阶段的实验性小分子,FDA认证的药物按照其结构和功能分别进行了分类, 而实验性小分子则全部根据其结构进行了分类。

药物数据库药物数据库

生物信息科学数据共享平台的药物数据库由两部分组成:用药指南和药物说明。用药指南侧重于阐述药物的用途,并提供症状、病名、禁忌等多种查询条件。药物说明存储了市场上供应的药物的使用说明,其中提供查询的药物名称为商品名。另外,我们还支持在线提交和批量提交。