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PAnnBuilder

PAnnBuilder 是一个自动对蛋白质进行注释的R软件包,可以提取16个公共数据库中的信息及54个其他生物信息注释软件包对大规模蛋白质组学数据进行注释。数据存储在R环境下的SQLite数据库中。

PAnnBuilder
基本局部比对搜索工具

BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)基本的局部相似性比对搜索工具。是用来将一个蛋白质或DNA序列和各种数据库中的其他序列进行比对的主要工具(Altschul,1990,1997)。BLAST搜索是研究一个蛋白质或基因的最基本的方法之一。

基本局部比对搜索工具
多重序列比对

序列多重比对在线服务后台使用ClustalW2进行比对,用户通过访问接口将自己准备好的序列粘贴到文本框或者选择要进行比对的文件后,点击提交按钮就可以实现序列的比对,比对的结果使用功能强大的JalView插件进行观看、编辑、以及结果的保存。

多重序列比对
FirstGlance

FirstGlance在Jmol系统是最简单的查看蛋白质、DNA、RNA及其复合物3D结构的工具,以Web方式展示,用很简单的几个功能键即可展示主要功能区,无需安装多余软件,兼容当前流行的浏览器和操作系统,简单易操作。

FirstGlance
系统发育分析

系统发育分析后台采用Phylip程序,用户上传比对好的序列文件后,可以在线进行系统发育分析,构建系统发育树。

系统发育分析