物种分类数据库
物种分类数据库

物种分类(Taxonomy)为数据中心内的其他数据提供物种及分类方面的支持。数据库的物种分类信息主要来源于 NCBI taxonomy数据库。

EST数据库
EST数据库

表达序列标签(Expressed Sequence Tag, EST)是基因表达的短cDNA 序列。EST序列携带着基因的某些信息,是寻找新基因、了解基因在基因组中的定位及其精细结构、mRNA可变剪接等研究的...

STS数据库
STS数据库

序列标签位点(Sequence Tagged Sites)是基因组序列标记位点,其主要来源有随机位点序列、表达基因序列、遗产标记序列等。STS提供染色体定位信息,对基因作图、基因定位具有重要意义。

引物数据库
引物数据库

引物(Primer)数据库接收研究者、研究组织以及专利申请者提交的引物数据并予以发布,注册用户可以通过FTP批量提交数据。

SRA数据库
SRA数据库

随着测序技术的发展,新的测序仪器开始投入使用,其产生的数据也和以往不同,测出的单条序列较短,为此我们将其称为小片段序列集(Short Read Archive)。最近NCBI和相关仪器的公司又共同制定...

/genome
基因组数据库

基因组数据库收录了常见的细菌、古菌和真核生物以及病毒、类病毒、质粒基因组的数据,数据库为用户提供数据收集、数据存储、数据的分类、数据检索与展示等。

iped2
蛋白质组数据库

With development of functional genomics research, large-scale proteomics study is now widespread and presents significant challenges in data storage, exchange and analysis.

Hotdata数据库
Hotdata数据库

生物学的研究生成了大量的有意义的数据,在学术期刊中公布相关成果时,需要通过不同的途径来公布这些数据,其中文献的补充材料是最普遍的方式。我们将这些文献的附加数据称为HotData。

DiSH
DiSH数据库

DiSH(Disease Subject Heading)系统将医学主题词和国际医学疾病分类体系整合,收集NCBI的医学主题词(MeSH)数据和WHO的国际疾病分类(ICD-10)数据,满足用户对于疾病分类标准...

普通核酸数据库
普通核酸数据库

普通核酸(CoreNucleotide)是指除EST、GSS、STS以外的其他核酸序列。其数据来源可以分为两部分:用户直接提交,以及数据中心根据需要从其他核酸数据库中下载的数据。

GSS数据库
GSS数据库

基因组勘测序列(Genome Survey Sequences,GSS)是基因组DNA克隆的一次性部分测序得到的序列。包括随机的基因组勘测序列、cosmid/BAC/YAC末端序列、通过Exon trapped获得基因组...

蛋白质数据库
蛋白质数据库

蛋白质数据库主要存储的是UniProt数据,其注释水平高(例如描述蛋白质的功能、作用域结构、翻译后修饰、突变体等),冗余水平最低,与其它数据库的整合性较好。

Trace数据库
Trace数据库

测序峰图(Trace)是测序仪生成的峰图文件,是序列最原始数据。Trace数据的整理、存储对于生物研究有着重要的意义。

GeneCenter
基因数据库

SDSPB Gene是专门存储基因信息的数据库。它并没有包含所有的已知的和预测的基因,主要存储的是经过完整测序的基因组信息,并且有活跃的研究团队提供这些信息,或者该基因组有详细测序...

GEO数据库
基因表达谱数据库

SDSPB_GEO的目标是构建一个类似GEO的数据库信息系统,可以收录基因表达相关的高通量数据,包括:基因芯片、SAGE、MPSS、蛋白质芯片、质谱、chip-chip、arrayCGH。提供相关...

BioMedAb
生物医学文献摘要数据库

生物医学摘要数据库(BioMedAb),是由上海生物信息技术中心下属的生物信息科学数据共享平台维护。其数据来源为MEDLINE,MEDLINE是PubMed最大的组成部分,是由美国国家医学图书馆...

drug
药物数据库

生物信息科学数据共享平台的药物数据库由两部分组成:用药指南和药物说明。用药指南侧重于阐述药物的用途,并提供症状、病名、禁忌等多种查询条件。