生物信息科学数据共享平台简介

生物信息科学数据共享平台主要承担上海生物信息技术研究中心的生命科学数据共享任务和生命科学数据分析工具开发/整合任务。基本职能包括生命科学数据的提交、发布和整合，生命科学数据库的开发、维护和更新，生命科学数据分析工具的开发、整合和在线服务。围绕这三大基本职能，目前生命科学数据中心提供两大类服务：数据/数据库和数据分析软件在线服务。 数据中心开发与数据服务相关的系统包括以核酸为代表的在线/离线提交系统，与国际知名数据库格式兼容的数据提取转换加载系统，BioEngine生命科学数据查询系统，数据查询结果实时下载和FTP下载服务，用户注册和管理系统。依托这些服务系统，数据中心能够提供普通核酸数据的在线/离线递交，EST数据的离线提交，Trace数据的离线提交，序列数据的查询和下载服务，物种库加载、查询、分析和统计服务， HotData数据（生物医学文献相关的热点数据）采集、加工、查询和下载服务，以及以血吸虫为代表的生命科学主题数据库与特色数据库开放服务。相关数据服务网站位于http://lifecenter.sgst.cn。 数据中心以中心内部课题组的研究开发的生物信息数据分析算法原型和国内外研究单位开发的成熟算法/工具为基础，通过二次开发、包装整合等技术手段，提供了一些在线分析/计算服务。BLAST服务，能够进行包括人类基因组在内的9个物种的核酸、蛋白质比对服务，以及包括NCBI提供的非冗余核酸库、非冗余蛋白库在内的28个普通生物序列数据库的核酸、蛋白质比对服务。EST及Contig序列拼接及分析、微生物基因组注释、分子进化及系统发育分析、肽指纹图谱分析、蛋白质组学信息分析、生物芯片数据分析、蛋白质相互作用分析、多蛋白信息分析系统等生命科学数据在线分析平台。相关服务网站位于http://biodb.sgst.cn。 为了保证这两大服务功能的正常服务能力，数据中心还制定了生命科学数据在线递交策略，包括已支持的数据类型的大批量数据递交策略，未支持的数据类型的大批量数据递交流程和应对方案，数据分析软件在线服务的开发流程和服务策略。此外，还提供了网络服务响应系统、包括用户分级分类管理、访问管理与服务管理在内的后台管理系统等。通过这些措施，有力的保障了数据中心的对外/对内服务能力。

数据中心的建设目标

生物信息科学数据共享平台作为上海市“一网两库”系统“上海科技基础数据库”的重要组成部分，承担着上海生物信息技术研究中心的数据共享等工程性任务，是上海市科技数据共享服务系统的重要环节之一。其主要目标包括：

1. 通过建立数个生命科学综合数据库及一批主体数据库，整合上海市各学科的数据资源，并充分利用国外、国内生命科学数据资源为国内所用，从而促进生命科学数据资源在国内的共享、流动和高效利用。
2. 通过自行研发、二次开发、整合等技术手段，对中心开发的生命科学数据分析处理算法进行规范化、工程化和产品化。并提供典型生命科学数据分析算法和流程的在线服务。
3. 通过直接与引导中间机构加入等多种方式，提供各类科学数据相关服务，促进行生命科学科研、教育的发展，以及推动医药产业、信息服务业的发展。
4. 生物信息科学数据共享平台还兼具上海市生命科学领域科学数据管理职能，是上海市生命科学领域科学数据的汇交接收单位，肩负着此类数据的接收、加工、整合、建库、发布、数据分发等职能。

我们的成员

生物信息科学数据共享平台是一支年轻而富有活力的队伍，人员主要来自于生命科学相关专业和信息技术相关专业，大部分具有较深的工程技术经验。我们欢迎有志于生命科学数据共享和数据分析的人才加盟。

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